Datenbank Manual
Queries allgemein
In der Task Bar befindet sich das Query-Symbol. Diese Funktion kann genutzt werden, um Datensätze anhand unterschiedlicher Parameter zu durchsuchen und vor allem eingegebene Daten für BOLD zu exportieren.
Im linken Menü unter Query finden sich die Tabellen, die durchsucht werden können. Dabei handelt es sich um jene Tabellen, die auch unter „Data“ zu finden sind. Durch Klick auf die Tabelle Collection Object erscheinen nun alle Felder, die zu dieser Tabelle gehören. Das gewünschte Feld kann per Doppelklick ausgewählt werden.
Alle ausgewählten Felder erscheinen nun in einer Liste. In der ersten Spalte dieser Liste sind jene Tabellen-Icons abgebildet, die anzeigen aus welcher Tabelle das gewählte Feld kommt. Anschließend folgt die Bezeichnung des Feldes. In der dritten Spalte befindet sich eine Checkbox. Wird diese Checkbox angeklickt, so wird der Operator nach dem gesucht werden soll negiert (beispielsweise „Feld soll nicht größer gleich sein“). Als nächstes können aus dem Dropdown-Menü die Operatoren gewählt werden. Diese unterscheiden sich abhängig von der Art des Feldes. Nummernfelder verfügen über die Operatoren „gleich“, „größer“, „kleiner“, „größer gleich“, „kleiner gleich“, „between“ (z.B. between 0-100), „in“ (z.B. findet mit der Eingabe “16, 127-400, 55, 66-68” alle Einträge, welche die Zahlen 16, 127 bis 400, 55 und 66 bis 68 enthalten) und „empty“ (alle Felder, die leer sind). Für ein Textfeld stehen die Operatoren „contains“, „like“ (ermöglicht die Suche mit *), „gleich“, „in“, „between“, und „empty“ zur Verfügung.
Jedes Feld kann um folgende Operatoren ergänzt werden:
- Show: zeigt Felder in den Ergebnissen, wenn es aktiviert ist. Das Ausschalten ist sinnvoll, wenn man ein Feld für eine Abfrage benötigt, dieses Feld aber nicht in den Ergebnissen sehen möchte.
- Prompt: Öffnet ein Dialogfeld, das die Bearbeitung der Abfrage zulässt.
- Always: Wenn diese Checkbox nicht aktiviert ist (Standard), beinhaltet das Ergebnis alle IDs, anstatt nur jene die der Abfrage entsprechen (nützlich für Suche nach Prep Types und Determinations).
Queries können gespeichert werden (Button „Save“ rechts unten), sodass Abfragen wiederholt werden können ohne alle Felder erneut aussuchen zu müssen.
Export/Import Queries: Durch Rechtsklick auf „Saved Queries“ können gespeicherte Queries exportiert/importiert und so an KollegInnen geschickt werden, die diese Query wiederum importieren.
Vorlagen
Allgemeine Abfragen
Laden Sie dafür diese Query-Datei herunter, entpacken diese und importieren Sie die Datei in Specify:
- Klicken Sie mit der rechten Maustaste auf “Saved Queries” im linksstehenden Menü.
- Wählen Sie “Import Queries”
- Wählen Sie die eben heruntergeladene Datei aus => Öffnen
- Wählen Sie alle zur Verfügung stehenden Queries aus.
- Die Queries sollten nun in der linksstehenden Tabelle zu finden sein.
Nun sollen die Abfragen durchgeführt und die Datenbankeinträge in eine Excel Datei exportiert werden:
- Klicken Sie auf die Query Collection Data und klicken nun auf “search” rechts unten
- Klicken Sie nun auf “Export Grid to MS Excel” in der grünen Leiste und wählen den passenden Speicherort und Mappennamen.
- Die exportierte Exceldatei ist im .xls Format gespeichert und kann jetzt von Ihnen unabhängig von der Datenbank bearbeitet werden.
Export für BOLD (Specimen Data/ Metadata)
Laden Sie dafür diese Query-Datei herunter, entpacken diese und importieren Sie die Datei in Specify wie oben beschrieben.
- Machen sie alle relevanten Queries: Specimen Data, Specimen Detail, Taxonomy, Voucher Info.
- Kopieren Sie die Daten nun in die BOLD Excel-Vorlage. Beachten Sie, dass die ABOL Datenbank Namen in zwei Felder speichert (Vor- und Nachname). Diese müssen entsprechend in Excel zu einem Feld zusammengefügt werden für die BOLD Liste.
- Laden Sie nun die BOLD-Vorlage in Bold hoch
[Auf unserer Homepage finden Sie einen Quickguide für BOLD und dessen Anwendungen]- Loggen Sie sich ein und klicken auf den Link Workbench.
- Legen Sie ein neues Project an oder wählen ein bestehendes aus.
- Klicken Sie nun in der linken Spalte unter Project auf Uploads => Specimen Data => Initiate Batch Submission (sollten Unklarheiten bestehen, folgen Sie der Anleitung auf der BOLD Website).
Abonniere unseren Newsletter
Aktuelle News
M. SonnleitnerABOL-BioBlitz in den Hohen Tauern8. August 2024 - 14:55
Der letzte ABOL-BioBlitz 2024 bei den Tagen der Artenvielfalt fand am ersten Augustwochenende im Nationalpark Hohe Tauern statt. Bei schon fast traditionell schlechtem Wetter strömten die etwa 75 Expert:innen aus, um im Habachtal im Salzburger Teil des Nationalparks Hohe Tauern die Biodiversität zu erfassen. Die Regenpausen wurden genutzt, um Insekten und andere Gliederfüßer dokumentiert zu erwischen. Leider waren […]
M. SonnleitnerGEO-Tag der Artenvielfalt im Geopark Karawanken17. July 2024 - 15:03
Am ersten Juli-Wochenende gastierte der ABOL-BioBlitz beim GEO-Tag der Artenvielfalt im Geopark Karawanken, heuer erstmals in Südkärnten. Nach der Begrüßung und einleitenden Worten in Bleiburg wurde am Nachmittag und Abend des ersten Tages das Globasnitzbachtal untersucht. Dort war für jede und jeden was dabei – Bach, Hochstauden, Wälder, und auch wunderbare artenreiche Wiesen, die Botaniker- […]
N. Fial10 Jahre ÖEG-Insektencamp17. July 2024 - 11:09
Parallel zum Tag der Artenvielfalt im Biosphärenpark Wienerwald war ABOL vom 6. bis 9. Juni bereits zum dritten Mal beim ÖEG-Insektencamp vertreten. Wie ABOL feierte das Insektencamp heuer sein 10-jähriges Jubiläum, heuer fand es im Naturpark Karwendel in Tirol statt Zu diesem Anlass wurden alle Teilnehmer:innen mit liebevoll gestalteten T-Shirts überrascht. Mit einem lachenden und […]